Organizační struktura stavební společnosti ŽSD a. s. je dvoustupňová. První stupeň představuje vedení společnosti jako řídicí orgán, druhý stupeň tvoří divize jako orgán výkonný.

V kompetenci vedení společnosti je vymezovat základní strategické cíle, vystupovat jménem společnosti v obchodních jednáních a řídit ji po stránce obchodní, technické, investiční, finanční a ekonomické. Vedení společnosti zároveň koordinuje výrobní program a integrovaný systém zajišťující řízení jakosti, řízení vztahu k životnímu prostředí a řízení bezpečnosti a ochrany zdraví při práci.

Do oblasti působnosti divizí patří zabezpečování realizace zakázek a plnění finančního plánu. Divize jsou rozděleny podle odbornosti na divize Odpady, Pozemní stavby, Praha, Inženýring a Demolice. Jde o samostatné organizační jednotky, které mají svůj vlastní výrobní program a samostatnou ekonomiku, za jejíž splnění nesou plnou odpovědnost ředitelé divizí. Vztah mezi divizemi je založen na vzájemné spolupráci s vědomím příslušnosti k téže společnosti.

Vedení společnosti: